指存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)，填充于核膜、網(wǎng)質(zhì)體、高爾基體等液泡系統(tǒng)與線粒體、葉綠體等膜狀構(gòu)造之間的連續(xù)性結(jié)構(gòu)。在電子顯微鏡下呈無結(jié)構(gòu)的部分，細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)在細(xì)胞分區(qū)法方面，它是與除微粒體分區(qū)以外的上清分區(qū)相對(duì)應(yīng)的部分，它含有各種可溶性蛋白質(zhì)（例如構(gòu)成微管的蛋白質(zhì)的單量體）和酶（例如有關(guān)分解糖的各種酶）或核酸（例如轉(zhuǎn)移RNA）等。另外，一般認(rèn)為細(xì)胞質(zhì)或原生質(zhì)的物理特性主要表現(xiàn)為這種細(xì)胞質(zhì)基質(zhì)的性質(zhì)。