遺傳密碼子具有以下基本特點(diǎn):
1)每個密碼子三聯(lián)體(triplet)決定一種氨基酸;
2)兩種密碼子之間無任何核苷酸或其它成分加以分離,即密碼子無逗號;
3)密碼子具有方向性,例如AUC是Ile的密碼子,A為5'端堿基,C為3'端堿基。因此密碼也具有方向性,即mRNA從5'端到3'端的核苷酸排列順序就決定了多肽鏈中從N端到C端的氨基酸排列順序;
4)密碼子有簡并性(degeneracy)一種氨基酸有幾個密碼子,或者幾個密碼子代表一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼子的簡并性。除了Met和Trp只有一個密碼子外,其它氨基酸均有二個以上密碼子,例如Arg有6個密碼子。
5)共有64個密碼子,其中AUG不僅是Met或者fMet(在原核細(xì)胞)的密碼子,也是肽鏈合成的起始信號,故稱AUG為起始密碼子。UAA、UAG和UGA為終止密碼子,不代表任何氨基酸,也稱為無意義密碼子。
6)密碼子有通用性,即不論是病毒、原核生物還是真核生物密碼子的含義都是相同的。但真核細(xì)胞線粒體mRNA中的密碼子與胞漿中mRNA的密碼子有以下三點(diǎn)不同:一是線粒體中UGA不代表終止密碼子,而是編碼Trp;二是肽鏈內(nèi)的Mer由AUG和AUA二個密碼子編碼,起始部位的Met由AUG、AUA、AUU和AGG均為密碼;三是AGA和AGG不是Arg的密碼子,而是終止密碼子,即UAA、UAG、AGA和AGG均為終止密碼子。
密碼子結(jié)構(gòu)與氨基酸側(cè)鏈極性之間有一定關(guān)系.
1)氨基酸側(cè)鏈極性性質(zhì)在多數(shù)情況下由密碼子的第二個堿基決定。第二個堿基為嘧啶(Y)時,氨基酸側(cè)鏈為非極性,第二個堿基為嘌呤(P)時,氨基酸側(cè)鏈側(cè)有極性.
2)當(dāng)?shù)谝粋堿基為U或A,第二個堿基為C,第三個堿基無特異性時,所決定的氨基酸側(cè)鏈為極性不帶電;
3)當(dāng)?shù)谝粋堿基不是U,第二個堿基是G時,氨基酸側(cè)鏈則帶電。在此前提下,若第一個是C或A時,表示帶正電的氨基酸;第一、第二個堿基分別是G、A時,此種氨基酸帶負(fù)電。但上述關(guān)系也有個別例外。